Gráfico volcán
Los gráficos volcán muestran la relación entre la diferencia entre grupos (expresada como cambio de pliegue en log) y los valores p de la prueba que compara las intensidades de los picos. Esto ofrece una vista general de los resultados estadísticamente significativos y de sus tamaños de efecto. DiffBind proporciona la función dba.plotVolcano() para crear estos gráficos.
El objeto ar_diff contiene los resultados del análisis de unión diferencial.
Este ejercicio forma parte del curso
ChIP-seq con Bioconductor en R
Instrucciones del ejercicio
- Crea un gráfico volcán.
- Examina el gráfico. ¿Dónde se encuentran los resultados significativos?
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Create a volcano plot
___(ar_diff)