¿Te parecen iguales estas muestras?
Examinar gráficos de PCA te permite hacerte una idea de las similitudes y diferencias entre muestras a escala global. Usando la salida generada durante el control de calidad de las muestras, es sencillo generar gráficos de PCA de los datos procesados. Abajo tienes un gráfico para las cuatro muestras que pasaron el control de calidad.

Examina el gráfico y luego valora las siguientes afirmaciones. ¿Cuáles son verdaderas?
- Las muestras se agrupan por condición.
- Un gráfico como este se puede crear con la función
plotPrincomp(). - Con un gráfico de PCA es fácil ver qué picos difieren más entre grupos.
Este ejercicio forma parte del curso
ChIP-seq con Bioconductor en R
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