Vizualizace Weibullova modelu
V tomto cvičení zreprodukujeme příklad z videa a projdeme si tyto kroky:
- Výpočet Weibullova modelu
- Definice „imaginárních pacientů"
- Výpočet křivek přežití
- Vytvoření
data.frames informacemi o křivkách přežití - Vykreslení grafu
Zaměříme se teď na poslední dva kroky.
Balíčky survival, survminer a reshape2 a data GBSG2 jsou v tomto cvičení načteny za tebe.
Weibullův model wbmod a data imaginárních pacientů newdat, která jsi už vypočítal/a, jsou také k dispozici.
Toto cvičení je součástí kurzu
Survival Analysis in R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Use cbind() to combine the information in newdat with t
surv_wbmod_wide <- cbind(newdat, t)
# Use melt() to bring the data.frame to long format
surv_wbmod <- melt(surv_wbmod_wide, id.vars = c("___", "___"), variable.name = "surv_id", value.name = "___")