1. Učit se
  2. /
  3. Kurzy
  4. /
  5. Survival Analysis in R

Connected

Cvičení

Vizualizace Coxova modelu

V tomto cvičení si zopakujeme příklad z videa a projdeme jednotlivé kroky:

  • Výpočet Coxova modelu
  • Definování „fiktivních pacientů"
  • Výpočet křivek přežití
  • Vytvoření data.frame s informacemi o křivkách přežití
  • Vykreslení grafu

V tomto cvičení se zaměříme na poslední dva kroky.

Balíčky survival a survminer a data GBSG2 jsou v tomto cvičení načteny za tebe. Coxův model cxmod, data fiktivních pacientů newdat a informace o křivkách přežití cxsf z předchozího cvičení jsou také dostupné.

Pokyny 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Pomocí funkce surv_summary() vytvoř data.frame potřebný k vykreslení křivek přežití. Použij cxsf (viz kód před cvičením).
  • Prohlédni si objekt surv_cxmod0 pomocí head() a prozkoumej jednotlivé sloupce.