Závěrečný úkol: Coxův model
Na závěr kurzu se pojďme vrátit k datasetu rakoviny plic, který jsme stručně použili v posledních dvou kapitolách. Připomeňme si: tento dataset obsahuje informace o přežití pacientů s pokročilou rakovinou plic ze skupiny North Central Cancer Treatment Group. Událost je uložena v proměnné status, která nabývá hodnoty 2, pokud pacient nepřežil. Skóre výkonnosti (proměnná performance) měří, jak dobře je pacient schopen vykonávat běžné denní aktivity (špatně=0, dobře=100), přičemž hodnocení provádí lékař. Chceme zjistit, jaká je souvislost mezi konkrétními hodnotami skóre výkonnosti a dobou přežití.
Toto cvičení je součástí kurzu
Survival Analysis in R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Compute Cox model and survival curves
cxmod <- ___(___(___, ___) ~ ___, data = lung)
new_lung <- data.frame(performance = ___)
cxsf <- ___(cxmod, data = ___, newdata = ___, conf.type = "none")