Odhad mediánu přežití pomocí Weibullova modelu
Teď můžeme odhadnout přežití pacientek s rakovinou prsu z datasetu GBSG2 pomocí Weibullova modelu (funkce survreg()).
Nezapomeň, že Weibullův model odhaduje hladkou křivku přežití – na rozdíl od schodovité funkce, kterou počítá metoda Kaplana a Meiera.
Funkce predict() s argumentem type = "quantile" umožňuje vypočítat kvantily distribuční
funkce. Využijeme ji k výpočtu mediánu přežití.
Balíček survival a dataset GBSG2 jsou v tomto cvičení už načteny.
Toto cvičení je součástí kurzu
Survival Analysis in R
Pokyny k cvičení
- Odhadni Weibullův model pro pacientky s rakovinou prsu.
- Vypočítej medián přežití z tohoto modelu pomocí funkce
predict()s argumentemtype = "quantile".
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)
# Compute the median survival from the model
predict(wb, type = "quantile", p = ___, newdata = data.frame(1))