在 Python 中查看 .mat 的结构

本练习将带您查看之前载入的 MATLAB 字典中包含了什么内容。

文件 'albeck_gene_expression.mat' 已载入到变量 mat 中。下列库也已按如下方式导入：

import scipy.io
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

该文件同样包含来自 UCDavis Albeck 实验室的基因表达数据。

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Python 数据导入入门

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练习说明

对字典 mat 使用 .keys() 方法并打印其键。大多数键（实际上，凡是不以 '__' 开头和结尾的键）都是对应 MATLAB 环境中的变量。
打印 mat 中键 'CYratioCyt' 所对应值的类型。回忆：mat['CYratioCyt'] 即可访问该值。
使用 numpy 的 shape() 函数打印键 'CYratioCyt' 所对应值的形状。
运行整个脚本，查看振荡型的基因表达数据！

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Print the keys of the MATLAB dictionary
print(____)

# Print the type of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Print the shape of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Subset the array and plot it
data = mat['CYratioCyt'][25, 5:]
fig = plt.figure()
plt.plot(data)
plt.xlabel('time (min.)')
plt.ylabel('normalized fluorescence (measure of expression)')
plt.show()

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