G. scandens'te gaga derinliği hiç kalıtılabilir mi?
G. scandens'te gaga derinliğinin kalıtılabilirliği düşük görünüyor. Belki de bu gözlenen kalıtılabilirlik sadece şans eseri elde edildi ve aslında türde gaga derinliği pek de kalıtılabilir değil. Bunu burada test edeceksin. Bunun için bir çiftler permütasyon testi yapacaksın.
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
Python ile İstatistiksel Düşünme (Bölüm 2)
Egzersiz talimatları
- Kalıtılabilirlik çoğaltımlarından oluşan dizini başlat. 10.000 çift permütasyon çoğaltımı alacağız.
- Çoğaltımları üretmek için bir
fordöngüsü yaz.np.random.permutation()kullanarakbd_parent_scandensdizisini permüte et.- Son egzersizde yazdığın
heritability()işlevini kullanarak permüte edilmiş dizi ilebd_offspring_scandensdizisi arasındaki kalıtılabilirliği hesapla. Sonucu çoğaltımlar dizisine kaydet.
- p-değerini, son egzersizde hesapladığın gözlenen
heritability_scandensdeğerinden büyük olan çoğaltımların sayısı olarak hesapla.
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Initialize array of replicates: perm_replicates
perm_replicates = ____
# Draw replicates
for i in range(10000):
# Permute parent beak depths
bd_parent_permuted = ____
perm_replicates[i] = ____
# Compute p-value: p
p = np.sum(____ >= ____) / len(____)
# Print the p-value
print('p-val =', p)