Kvantiler för överlevnadskurvan från en Weibull-modell
Nu kan vi skatta överlevnaden för bröstcancerpatienterna i GBSG2-data med hjälp av en Weibull-modell.
Funktionen predict() med type = "quantile" låter oss beräkna kvantilerna för fördelningsfunktionen. Som vi har lärt oss i kursen är överlevnadsfunktionen 1 minus fördelningsfunktionen
(\(S = 1 - D\)), så vi kan enkelt beräkna kvantilerna för överlevnadsfunktionen med hjälp av predict().
Paketet survival och GBSG2-data är redan inlästa i den här övningen.
Den här övningen är en del av kursen
Överlevnadsanalys i R
Övningsinstruktioner
- Skatta en Weibull-modell för bröstcancerpatienterna.
- Ta fram den tidpunkt där sannolikheten att överleva längre än den tidpunkten är 70 procent (med hjälp av funktionen
predict()medtype = "quantile").
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(___, ___) ~ 1, data = GBSG2)
# 70 Percent of patients survive beyond time point...
predict(wb, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(1))