Skatta medianöverlevnad med en Weibull-modell
Nu kan vi skatta överlevnaden för bröstcancerpatienterna i datamängden GBSG2 med hjälp av en Weibull-modell (funktionen survreg()).
Kom ihåg att Weibull-modellen skattar en slät överlevnadsfunktion i stället för en trappstegsfunktion, vilket är vad Kaplan-Meier-metoden skattar.
Funktionen predict() med type = "quantile" gör det möjligt att beräkna kvantilerna för fördelningsfunktionen.
Vi använder detta för att beräkna medianöverlevnaden.
Paketet survival och datamängden GBSG2 är redan inlästa i den här övningen.
Den här övningen är en del av kursen
Överlevnadsanalys i R
Övningsinstruktioner
- Skatta en Weibull-modell för bröstcancerpatienterna.
- Beräkna medianöverlevnaden från modellen med funktionen
predict()och argumentettype = "quantile".
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)
# Compute the median survival from the model
predict(wb, type = "quantile", p = ___, newdata = data.frame(1))