DGE-teori: Metadata

Använd informationen nedan för att skapa en metadata-dataram för fibrosets räknedata. Dataraamen ska heta metadata och ha kolumnerna genotype och condition. Provnamnen (t.ex. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 osv.) ska vara radnamnen i dataraamen:

smoc2 metadata

Den här övningen är en del av kursen

RNA-Seq med Bioconductor i R

Visa kurs

Övningsinstruktioner

Skapa en teckenvektorn med namnet genotype för ovanstående data med hjälp av c().
Skapa en teckenvektorn med namnet condition för ovanstående data med hjälp av c().
Skapa en dataram med namnet smoc2_metadata med hjälp av data.frame() och teckenvektorerna genotype och condition.
Skapa en vektor med provnamn med hjälp av c() och tilldela den till dataramens radnamn med hjälp av rownames().

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)

Redigera och kör kod