Kom igångKom igång gratis

Öva med DESeq2-vignetten

I videorna undersöker vi skillnader i genuttryck mellan normala prover och fibros-prover från vildtypssmöss. I de här övningarna undersöker vi genuttryck mellan normala prover och fibros-prover från möss som överuttrycker genen smoc2.

När du utför differentiell expressionsanalys på egen hand är DESeq2-vignetten det första stället att söka svar på dina frågor. Utforska DESeq2-vignetten i den här övningen och använd den för att välja det bästa svaret på frågan nedan:

Varför använder vi onormaliserade räkningar som indata till DESeq2?

OBS: Onormaliserade innebär att räkningarna inte har justerats för biblioteksstorlek, det vill säga det totala antalet läsningar per prov.

Den här övningen är en del av kursen

RNA-Seq med Bioconductor i R

Visa kurs

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Gör teori till handling med en av våra interaktiva övningar

Starta övningen