Проверьте размер каждого набора

Чтобы убедиться, что train_test_split() отработал так, как вы ожидали, проверьте длину X_train и X_test и посмотрите, сколько записей содержится в каждом наборе. Для этого можно использовать функцию len() или атрибут .shape.