Teoria DGE: Metadate

Folosește informațiile de mai jos pentru a crea un data frame de metadate pentru datele de numărare din fibroză, numit metadata, cu coloanele genotype și condition. Numele eșantioanelor (de ex. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 etc.) trebuie să fie numele rândurilor din data frame:

smoc2 metadata

Acest exercițiu face parte din cursul

RNA-Seq cu Bioconductor în R

Vezi cursul

Instrucțiuni pentru exercițiu

Creează un vector de caractere numit genotype pentru datele de mai sus, folosind c().
Creează un vector de caractere numit condition pentru datele de mai sus, folosind c().
Creează un data frame numit smoc2_metadata folosind data.frame() și vectorii de caractere genotype și condition.
Creează un vector cu numele eșantioanelor folosind c() și atribuie-l numelor rândurilor din data frame cu ajutorul funcției rownames().

Exercițiu interactiv practic

Încearcă acest exercițiu completând acest cod de exemplu.

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)

Editează și rulează codul