ÎncepețiÎncepe gratuit

Exersează cu vignette-ul DESeq2

În videoclipuri, explorăm diferențele de expresie genică dintre eșantioanele normale și cele cu fibroză provenite de la șoareci de tip sălbatic. În aceste exerciții, vom explora expresia genică dintre eșantioanele normale și cele cu fibroză provenite de la șoareci care supraexprimă gena smoc2.

Atunci când efectuezi analize de expresie diferențială pe cont propriu, vignette-ul DESeq2 va fi primul loc unde vei căuta răspunsuri la orice întrebări. În acest exercițiu, explorează vignette-ul DESeq2 și folosește-l pentru a alege cel mai bun răspuns la întrebarea de mai jos:

De ce folosim numărători nenormalizate ca date de intrare pentru DESeq2?

NOTĂ: Nenormalizat înseamnă că numărătorile nu au fost ajustate în funcție de dimensiunea bibliotecii, adică numărul total de citiri contorizate per eșantion.

Acest exercițiu face parte din cursul

RNA-Seq cu Bioconductor în R

Vezi cursul

Exercițiu interactiv practic

Transformă teoria în practică cu unul dintre exercițiile noastre interactive

Începe exercițiul