Stima e visualizzazione di una curva di sopravvivenza
Diamo un'occhiata alla sopravvivenza delle pazienti con tumore al seno.
In questo esercizio lavorerai di nuovo con il dataset GBSG2.
I pacchetti survival e survminer e i dati GBSG2 sono già caricati per te in questo esercizio.
Questo esercizio fa parte del corso
Analisi di sopravvivenza in R
Istruzioni dell'esercizio
- Stima una funzione di sopravvivenza per le pazienti con tumore al seno.
- Visualizza la funzione di sopravvivenza stimata usando la funzione
ggsurvplot(). - Aggiungi al grafico una risk table che mostri il numero di pazienti sotto osservazione. Puoi farlo usando l'argomento
risk.table. - Aggiungi al grafico una linea che indichi la sopravvivenza mediana. Puoi farlo usando l'argomento
surv.median.line.
esercizio interattivo pratico
Prova questo esercizio completando questo codice di esempio.
# Kaplan-Meier estimate
km <- survfit(Surv(___, ___) ~ ___, data = ___)
# Plot of the Kaplan-Meier estimate
ggsurvplot(___)
# Add the risk table to plot
ggsurvplot(___, ___ = TRUE)
# Add a line showing the median survival time
ggsurvplot(___, ___ = TRUE, ___ = "hv")