Stima della curva di sopravvivenza con survreg()
Ora possiamo stimare la sopravvivenza delle pazienti con tumore al seno nei dati GBSG2 usando un modello di Weibull.
La distribuzione di Weibull ha due parametri, che determinano la forma della curva di sopravvivenza.
Per questo esercizio, il pacchetto survival e i dati GBSG2 sono già caricati per te.
Questo esercizio fa parte del corso
Analisi di sopravvivenza in R
Istruzioni dell'esercizio
- Stima un modello di Weibull per le pazienti con tumore al seno.
- Calcola la curva di sopravvivenza stimata dal modello usando la funzione
predict()contype = "quantile". - Crea un
data.framecon i punti temporali e le corrispondenti probabilità di sopravvivenza. - Visualizza le prime righe del risultato usando la funzione
head().
esercizio interattivo pratico
Prova questo esercizio completando questo codice di esempio.
# Weibull model
wb <- ___(___(___, ___) ~ ___, data = ___)
# Retrieve survival curve from model probabilities
surv <- seq(.99, .01, by = -.01)
# Get time for each probability
t <- predict(___, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(1))
# Create data frame with the information
surv_wb <- data.frame(time = ___, surv = ___)
# Look at first few lines of the result
head(___)