Segmenta el corazón
En este capítulo, trabajaremos con datos de imagen de resonancia magnética (RM) del Sunnybrook Cardiac Dataset. La imagen completa es una serie temporal 3D que cubre un único latido. Estos datos los utilizan los radiólogos para medir la fracción de eyección: la proporción de sangre expulsada del ventrículo izquierdo en cada latido.
Para empezar, segmenta el ventrículo izquierdo a partir de un único corte del volumen (im). Primero, filtrarás y enmascararás la imagen; después, etiquetarás cada objeto con ndi.label().
Los ejercicios de este capítulo tienen las siguientes importaciones:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Este ejercicio forma parte del curso
Análisis de imágenes biomédicas en Python
ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio completando este código de ejemplo.
# Smooth intensity values
im_filt = ____
# Select high-intensity pixels
mask_start = np.where(____, 1, 0)
mask = ____
# Label the objects in "mask"
labels, nlabels = ____
print('Num. Labels:', ____)