Traslaciones
En este capítulo, usaremos datos de la Open Access Series of Imaging Studies para comparar cerebros de distintas poblaciones: jóvenes y mayores, hombres y mujeres, sanos y con enfermedad.
Para empezar, centra una única sección (slice) de un volumen cerebral 3D (im). Primero, encuentra el punto central en la matriz de la imagen y el centro de masas del cerebro. Después, traslada la imagen hasta el centro.
Todos los ejercicios de este capítulo incluyen estas importaciones:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Este ejercicio forma parte del curso
Análisis de imágenes biomédicas en Python
ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio completando este código de ejemplo.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)