DGE Theory: Metadata
Pomocí níže uvedených informací vytvoř datový rámec s metadaty pro data počtů fibrózy. Pojmenuj ho metadata a přidej do něj sloupce genotype a condition. Názvy vzorků (např. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 atd.) by měly tvořit názvy řádků datového rámce:
Toto cvičení je součástí kurzu
RNA-Seq s Bioconductorem v R
Pokyny k cvičení
- Pomocí
c()vytvoř znakový vektorgenotypepro výše uvedená data. - Pomocí
c()vytvoř znakový vektorconditionpro výše uvedená data. - Pomocí
data.frame()a znakových vektorůgenotypeaconditionvytvoř datový rámecsmoc2_metadata. - Pomocí
c()vytvoř vektor názvů vzorků a přiřaď ho k názvům řádků datového rámce pomocírownames().
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)