在生物醫學影像中,量化組織的形態(morphology),也就是形狀,是一項核心目標。組織的大小、形狀與一致性,往往能透露關鍵的健康資訊。
在這個練習中,請量測一張 3D 影像(vol)中左心室的體積。
vol
先計算左心室(標籤值為 1)的體素數量。再將其乘上每個體素的大小(mm$^3$)。(可在 vol.meta 中查看取樣率。)
vol.meta
本練習屬於課程
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準備好征服第 N 維吧!在課程一開始,你會學到如何以人類胸腔的 CT 影像為例,載入、建立並瀏覽 N 維影像。你也會運用實用的 ImageIO 套件,並精進你的 NumPy 與 matplotlib 技能。
透過轉換 X 光影像,把影像處理「剖析」到位。你會學到如何利用強度分佈來選取陣列的子區域,並使用卷積濾波器偵測有趣的特徵。你也會使用 SciPy 的 ndimage 模組,裡面包含大量實用的影像處理工具。
在本章中,你將切入影像分析的核心:物件量測。利用 4D 心臟時間序列,你會判斷病人是否可能罹患心臟疾病。過程中,你將學習影像分割、物件標記,以及形態學量測的基礎。
當前練習
最後一章,你需要動用你的大腦……還有數百個別人的!從超過 400 個開放取用的 MR 影像匯入資料,你會學到配準、重取樣與影像比較的基本概念。接著,你將使用擷取出的量測結果來評估阿茲海默症對大腦結構的影響。