Läs in bilder
I det här kapitlet arbetar vi med snitt från en datortomografi (CT) hämtad från The Cancer Imaging Archive. CT använder ett roterande röntgenrör för att skapa en 3D-bild av det undersökta området.
Bildens faktiska innehåll beror på vilket instrument som använts: fotografier mäter synligt ljus, röntgen och CT mäter strålningsabsorption, och MRI-skannrar mäter magnetfält.
Som en första övning använder du paketet imageio för att läsa in en enskild DICOM-bild från skanningsvolymen och undersöka några av dess egenskaper.
Den här övningen är en del av kursen
Biomedicinsk bildanalys i Python
Övningsinstruktioner
- Importera
imageio. - Läs in bilden "chest-220.dcm" med funktionen
imread(). - Skriv ut
type()ochshape(antal pixlar) förim.
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Import ImageIO
import imageio.v2 as ____
# Load "chest-220.dcm"
im = ____
# Print image attributes
print('Image type:', ____)
print('Shape of image array:', im.____)