DGE 이론: 메타데이터
아래 정보를 바탕으로 섬유화(fibrosis) 카운트 데이터에 대한 메타데이터 데이터 프레임을 만들어 보세요. 이름은 metadata이고, 열은 genotype와 condition으로 합니다. 샘플 이름(예: smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 등)은 데이터 프레임의 행 이름이어야 합니다:
이 연습은 강의의 일부입니다
R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq
연습 안내
- 위 데이터를 기준으로
c()를 사용해genotype라는 문자 벡터를 생성하세요. - 위 데이터를 기준으로
c()를 사용해condition이라는 문자 벡터를 생성하세요. data.frame()과genotype,condition문자 벡터를 사용해smoc2_metadata라는 데이터 프레임을 생성하세요.c()로 샘플 이름 벡터를 만들고,rownames()를 사용해 데이터 프레임의 행 이름으로 지정하세요.
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)