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연습 문제

DESeq2 결과 요약하기

참고: 이 연습 문제는 불러오는 데 조금 더 시간이 걸릴 수 있어요.

이제 결과를 추출했으니, summary() 함수를 사용해서 지정한 알파 수준에서 차등 발현된 유전자 수를 한눈에 살펴볼 수 있어요. 이 함수는 상향/하향 조절된 유전자의 개수와 비율을 출력하고, 독립적 필터링과 제거된 이상치에 대한 정보도 함께 제공합니다.

지침

100 XP
  • DESeq2의 summary() 함수를 사용해서 결과 객체 smoc2_res에서 차등 발현된 유전자가 몇 개인지 확인하세요.