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연습 문제

DESeq2 모델 - 결과 추출

참고: 이 연습 문제는 로딩에 다소 시간이 걸릴 수 있어요.

분산을 탐색해 보고 데이터가 DESeq2 모델에 잘 맞는다고 판단했으니, 이제 결과를 추출해 보겠습니다.

이전에 필요한 단계는 모두 수행되었다고 가정합니다. 여기에는 DESeq2 객체 dds_smoc2 생성과 DESeq() 함수 실행이 포함됩니다.

지침

100 XP
  • results() 함수를 사용해 유의수준(alpha) 0.05로 비교를 위한 대비(contrast)를 지정하세요. 관심 조건인 condition에 대해, normal 샘플 그룹을 기준 수준(base level)으로 하여 fibrosis 샘플 그룹의 결과를 출력하세요.