Uji permutasi: wild type versus heterozigot
Uji hipotesis bahwa panjang bout pada heterozigot dan wild type berdistribusi identik menggunakan uji permutasi.
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik
Petunjuk latihan
- Hitung selisih mean (heterozigot minus panjang bout wild type) dari himpunan data aktual, lalu simpan hasilnya dalam variabel
diff_means_exp. Arraynumpybout_lengths_wtdanbout_lengths_hetsudah tersedia dalam namespace Anda. - Gambar 10.000 replikasi permutasi dari selisih mean menggunakan
dcst.draw_perm_reps(). Anda juga dapat menggunakan fungsidcst.diff_of_means(), dan simpan hasilnya dalamperm_reps. - Hitung p-value, dengan mendefinisikan "setidaknya sama ekstremnya dengan" sebagai kondisi ketika selisih mean di bawah hipotesis nol lebih besar atau sama dengan nilai yang diamati secara eksperimental.
- Cetak p-value ke layar.
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Compute the difference of means: diff_means_exp
diff_means_exp = ____ - ____
# Draw permutation replicates: perm_reps
perm_reps = ____(____, ____,
____, size=____)
# Compute the p-value: p-val
p_val = ____(____ >= ____) / len(____)
# Print the result
print('p =', p_val)