Tịnh tiến
Trong chương này, chúng ta sẽ tận dụng dữ liệu từ Open Access Series of Imaging Studies để so sánh não của các nhóm khác nhau: trẻ và già, nam và nữ, khỏe mạnh và mắc bệnh.
Bắt đầu bằng cách căn giữa một lát cắt đơn của thể tích não 3D (im). Trước hết, hãy tìm điểm trung tâm trong mảng ảnh và tâm khối (center of mass) của não. Sau đó, tịnh tiến ảnh về tâm.
Tất cả các bài tập của chương này đều đã có các lệnh import sau:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Bài tập này là một phần của khóa học
Phân tích ảnh Y sinh học bằng Python
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)