Трансляции
В этой главе мы воспользуемся данными из Open Access Series of Imaging Studies, чтобы сравнить структуру мозга у разных групп участников: молодых и пожилых, мужчин и женщин, здоровых и больных.
Для начала выровняйте один срез 3D-объёма мозга (im) по центру. Найдите центральную точку массива изображения и центр масс мозга, а затем выполните сдвиг изображения к центру.
Во всех упражнениях этой главы используются следующие импорты:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Это упражнение является частью курса
Анализ биомедицинских изображений на Python
Интерактивное практическое упражнение
Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)