Obliczanie krzywej przeżycia na podstawie modelu Coxa
W tym ćwiczeniu odtworzymy przykład z filmu, wykonując kolejne kroki:
- Oblicz model Coxa
- Zdecyduj, kim są „fikcyjni pacjenci"
- Oblicz krzywe przeżycia
- Utwórz
data.framez informacjami o krzywej przeżycia - Narysuj wykres
W tym ćwiczeniu skupimy się na pierwszych trzech krokach, a dwa pozostałe wykonamy w kolejnym ćwiczeniu.
Pakiety survival i survminer oraz dane GBSG2 są już wczytane.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Analiza przeżycia w R
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Cox model
cxmod <- ___(Surv(time, cens) ~ horTh + tsize, data = GBSG2)
# Imaginary patients
newdat <- expand.grid(
horTh = levels(GBSG2$___),
tsize = quantile(GBSG2$___, probs = c(0.25, 0.5, 0.75)))
___(newdat) <- letters[1:6]
# Inspect newdat
newdat