1. Nauka
    2. /
  2. Kursy
    3. /
  3. Analiza sieci w R
Connected

ćwiczenie

Układy sieci w igraph

Pakiet igraph oferuje kilka wbudowanych algorytmów układu do wizualizacji sieci. W zależności od rozmiaru sieci różne układy mogą lepiej lub gorzej oddawać jej strukturę. Najlepszy układ to taki, który minimalizuje liczbę przecinających się krawędzi. W tym ćwiczeniu poznasz kilka z wielu dostępnych domyślnych algorytmów układu. Ponowne uruchomienie kodu dla każdego wykresu da nieco inny wariant tego samego typu układu – warto to zrobić kilka razy, aby znaleźć najlepiej wyglądającą wizualizację swojej sieci.

Instrukcje

100 XP
  • W funkcji plot zmień argument layout na layout_in_circle(), aby uzyskać sieć w układzie okrągłym.
  • W funkcji plot zmień argument layout na layout_with_fr(), aby uzyskać sieć w układzie Fruchtermana-Reingolda.
  • Możesz też określić układ, podając macierz współrzędnych (x, y) dla każdego wierzchołka. Użyj funkcji layout_as_tree(), aby wygenerować macierz m ze współrzędnymi, a następnie przekaż m do parametru layout w funkcji plot().
  • Wybór odpowiedniego układu bywa trudny. Na szczęście igraph udostępnia funkcję layout_nicely(), która sama stara się dobrać najlepszy układ dla danego obiektu grafu. Użyj tej funkcji, aby utworzyć macierz m1, a następnie zwizualizuj sieć na podstawie tych współrzędnych.