Asumsi model
Anda sudah melihat model Cox PH pada latihan pemrograman sebelumnya. Pada latihan ini, Anda akan memeriksa apakah model Anda memang sesuai. Model Anda masih tersimpan dalam objek fitCPH.
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Machine Learning untuk Analitik Pemasaran dengan R
Petunjuk latihan
- Periksa asumsi hazard proporsional dari model
fitCPHmenggunakancox.zph(). Simpan hasil uji dalam objek bernamatestCPHdan cetak. - Asumsi tampaknya dilanggar untuk satu variabel pada tingkat alfa 0,05. Yang mana? Plot koefisien beta terhadap waktu untuk variabel tersebut.
- Validasi model menggunakan cross validation dengan fungsi
validate()dari paketrms.
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Check proportional hazard assumption and print result
___ <- ___(fitCPH)
___(testCPH)
# Plot time-dependent beta
plot(___, var = "___")
# Load rms package
library(rms)
# Validate model
___(fitCPH, method = "___",
B = 10, dxy = TRUE, pr = FALSE)