Segmentasikan jantung
Pada bab ini, kita akan bekerja dengan data pencitraan magnetic resonance (MR) dari Sunnybrook Cardiac Dataset. Citra lengkapnya berupa deret waktu 3D yang mencakup satu detak jantung. Data ini digunakan oleh ahli radiologi untuk mengukur ejection fraction: proporsi darah yang dikeluarkan dari ventrikel kiri pada setiap denyut.
Untuk memulai, segmentasikan ventrikel kiri dari satu irisan volume (im). Pertama, Anda akan memfilter dan membuat mask pada citra; lalu beri label setiap objek dengan ndi.label().
Latihan dalam bab ini menggunakan impor berikut:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Latihan ini merupakan bagian dari kursus
Analisis Citra Biomedis dengan Python
Latihan interaktif langsung praktik
Cobalah latihan ini dengan melengkapi kode contoh ini.
# Smooth intensity values
im_filt = ____
# Select high-intensity pixels
mask_start = np.where(____, 1, 0)
mask = ____
# Label the objects in "mask"
labels, nlabels = ____
print('Num. Labels:', ____)