Bersiaplah menaklukkan dimensi ke-N! Untuk memulai kursus, Anda akan belajar cara memuat, membangun, dan menavigasi citra berdimensi-N menggunakan citra CT dada manusia. Anda juga akan memanfaatkan paket ImageIO yang bermanfaat serta mengasah keterampilan NumPy dan matplotlib Anda.

Data citra

Memuat gambar

Metadata

Plot gambar

Citra N-dimensi

Menumpuk citra

Memuat volume

Field of view

Plotting lanjutan

Membuat subplot

Iris gambar 3D

Plot tampilan lain

Eksplorasi

Kupas habis pemrosesan citra dengan mentransformasi citra rontgen. Anda akan belajar memanfaatkan pola intensitas untuk memilih subwilayah dari sebuah array, dan menggunakan filter konvolusional untuk mendeteksi fitur menarik. Anda juga akan menggunakan modul ndimage dari SciPy, yang berisi beragam alat pemrosesan citra yang sangat berguna.

Intensitas citra

Intensitas

Histogram

Masker

Buat sebuah mask

Menerapkan mask

Menyetel sebuah mask

Filter

Konvolusi filter

Fungsi filter

Pemulusan

Deteksi fitur

Deteksi tepi (1)

Deteksi tepi (2)

Mask dan Filter

Di bab ini, Anda akan masuk ke inti analisis citra: pengukuran objek. Dengan deret waktu jantung 4D, Anda akan menentukan apakah seorang pasien berisiko mengidap penyakit jantung. Sepanjang proses, Anda akan mempelajari dasar-dasar segmentasi citra, pelabelan objek, dan pengukuran morfologis.

Objek dan label

Segmentasikan jantung

Pilih objek

Ekstrak objek

Mengukur intensitas

Ukur varians

Histogram terpisah

Mengukur morfologi

Hitung volume

Hitung jarak

Tentukan titik pusat massa

Pengukuran dalam waktu

Ringkas deret waktu

Mengukur ejection fraction

Pengukuran

Untuk bab terakhir, Anda perlu menggunakan otak Anda... dan ratusan otak lainnya! Dengan data dari lebih dari 400 citra MRI akses terbuka, Anda akan mempelajari dasar-dasar registrasi, penyampelan ulang (resampling), dan perbandingan citra. Selanjutnya, Anda akan menggunakan pengukuran yang diekstrak untuk mengevaluasi dampak penyakit Alzheimer terhadap struktur otak.

Transformasi spasial

Translasi

Rotasi

Transformasi afin

Resampling dan interpolasi

Resampling

Interpolasi

Membandingkan citra

Mean absolute error

Intersection of the union

Menormalkan pengukuran

Mengidentifikasi potensi perancu

Menguji perbedaan antar kelompok

Menormalkan metrik

Perbandingan Citra

Chest CT Volume

Sunnybrook Cardiac MRI

RSNA Hand Radiograph

TCIA Chest CT (Sample)

OASIS Brain Measurements

Bidang pencitraan biomedis berkembang pesat dalam beberapa tahun terakhir—namun bagi pemula, bahkan memuat data pun bisa menjadi tantangan! Dalam kursus pengantar ini, Anda akan mempelajari dasar-dasar analisis citra menggunakan NumPy, SciPy, dan Matplotlib. Anda akan menavigasi pemindaian CT seluruh tubuh, melakukan segmentasi deret waktu MRI jantung, serta menentukan apakah penyakit Alzheimer mengubah struktur otak. Bahkan jika Anda belum pernah bekerja dengan citra sebelumnya, Anda akan menuntaskan kursus ini dengan seperangkat alat yang kokoh untuk memasuki bidang yang dinamis ini.

Intermediate Python

Pelajari dasar-dasar eksplorasi, manipulasi, dan pengukuran data gambar biomedis.

Analisis Citra Biomedis dengan Python

Pelajari dasar-dasar menjelajahi, memanipulasi, dan mengukur data citra biomedis. 

Citra N-dimensi

Create Your Free Account