Estimación y visualización de una curva de supervivencia
Echemos un vistazo a la supervivencia de las pacientes con cáncer de mama.
En este ejercicio, trabajamos de nuevo con el conjunto de datos GBSG2.
Los paquetes survival y survminer y los datos GBSG2 ya están cargados para ti en este ejercicio.
Este ejercicio forma parte del curso
Análisis de supervivencia en R
Instrucciones del ejercicio
- Estima una función de supervivencia para las pacientes con cáncer de mama.
- Visualiza la función de supervivencia estimada usando la función
ggsurvplot(). - Añade al gráfico una tabla de riesgo que muestre el número de pacientes en observación. Puedes hacerlo con el argumento
risk.table. - Añade al gráfico una línea que muestre la mediana del tiempo de supervivencia. Puedes hacerlo con el argumento
surv.median.line.
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Kaplan-Meier estimate
km <- survfit(Surv(___, ___) ~ ___, data = ___)
# Plot of the Kaplan-Meier estimate
ggsurvplot(___)
# Add the risk table to plot
ggsurvplot(___, ___ = TRUE)
# Add a line showing the median survival time
ggsurvplot(___, ___ = TRUE, ___ = "hv")