Açıklanan varyans
PCA modellerini anlamak için kullanılan ikinci yaygın grafik türü bir scree plottur. Scree plot, ana bileşen sayısı arttıkça açıklanan varyansı gösterir. Bazen kümülatif açıklanan varyans da çizilir.
Bu egzersizde ve sonrakinde, bölümün başında oluşturduğun pr.out modelinden bir scree plot için kullanılacak veriyi hazırlayacaksın. Bu tür bir grafiği oluşturmak için R’da yerleşik bir fonksiyon olmadığından, çizim için veriyi hazırlamak gerekir.
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
R ile Denetimsiz Öğrenme
Egzersiz talimatları
pr.out ve pokemon verileri çalışma alanında hâlâ mevcut.
pr.vardeğişkenine, ana bileşenlerin standart sapmalarının karesini (yani varyansı) ata. Ana bileşenlerin standart sapmaları, PCA model nesnesininsdevbileşeninde bulunur.pvedeğişkenine,pr.vardeğerini tüm ana bileşenlerin açıkladığı toplam varyansa bölerek hesaplanan açıklanan varyans oranını ata.
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Variability of each principal component: pr.var
pr.var <- ___
# Variance explained by each principal component: pve
pve <- ___ / ___