Weibull-model vergelijken met Kaplan-Meier-schatting
Laten we de overlevingscurve plotten die we uit het Weibull-model voor de GBSG2-data krijgen!
De pakketten survival en survminer en de GBSG2-data zijn voor je geladen in deze oefening.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Survivalanalyse in R
Oefeninstructies
- Bereken het Weibull-model voor de
GBSG2-data. - Bepaal de overlevingscurve uit het model.
- Plot de overlevingscurves die je uit de twee schattingen krijgt.
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Weibull model
wb <- ___(___(___, ___) ~ ___, ___)
# Retrieve survival curve from model
surv <- seq(.99, .01, by = -.01)
# Get time for each probability
t <- predict(___, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(___))
# Create data frame with the information needed for ggsurvplot_df
surv_wb <- data.frame(time = ___, surv = ___,
upper = NA, lower = NA, std.err = NA)
# Plot
ggsurvplot_df(fit = ___, surv.geom = ___)