De mediane overleving schatten met een Weibull-model
We kunnen nu de overleving van borstkankerpatiënten in de GBSG2-gegevens schatten met een Weibull-model (functie survreg()).
Onthoud: het Weibull-model schat een vloeiende overlevingsfunctie in plaats van een stapsgewijze functie, zoals de Kaplan-Meier-methode doet.
Met de functie predict() met type = "quantile" kunnen we de kwantielen van de verdelingsfunctie berekenen. We gebruiken dit om de mediane overleving te bepalen.
Het pakket survival en de GBSG2-gegevens zijn voor je geladen in deze oefening.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Survivalanalyse in R
Oefeninstructies
- Schat een Weibull-model voor de borstkankerpatiënten.
- Bereken de mediane overleving uit dit model met de functie
predict()entype = "quantile".
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)
# Compute the median survival from the model
predict(wb, type = "quantile", p = ___, newdata = data.frame(1))