Aan de slagGa gratis aan de slag

Verbindingen visualiseren

In deze oefening leer je hoe je de dikte van verbindingen in een netwerk aanpast op basis van hun gewicht, en hoe je verbindingen uit een netwerk verwijdert. Dat kan helpen om grote en sterk geclusterde netwerken beter te visualiseren. In dit introductiehoofdstuk heb je nog maar een glimp gezien van wat er mogelijk is met het visualiseren van igraph-netwerken. Je bouwt deze vaardigheden verder uit in de volgende hoofdstukken.

Deze oefening maakt deel uit van de cursus

Netwerkanalyse in R

Cursus bekijken

Oefeninstructies

  • Maak een vector w1 met verbindingsgewichten op basis van het aantal uren dat vrienden samen doorbrengen.
  • Plot het netwerk en zorg dat edge.width is ingesteld op de zojuist gemaakte vector met gewichten. Met edge.color = 'black' zorg je ervoor dat alle verbindingen zwart zijn.
  • Maak daarna een nieuw graafobject g2: dit is het g1-netwerk, maar dan met alle verbindingen waarvan het gewicht minder dan twee uur is verwijderd. Dit doe je met delete_edges(), dat twee argumenten verwacht: eerst het graafobject en daarna de subset van verbindingen die verwijderd moeten worden. In dit geval verwijder je alle verbindingen met een waarde van minder dan twee uur.
  • Plot tot slot het nieuwe netwerk g2 met de juiste vector van verbindingsdiktes en dezelfde lay-out.

Praktische interactieve oefening

Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.

library(igraph)

# Create a vector of weights based on the number of hours each pair spend together
w1 <- E(g1)$___

# Plot the network varying edges by weights
m1 <- layout_nicely(g1)
plot(g1, 
        vertex.label.color = "black", 
        edge.color = 'black',
        edge.width = ___,
        layout = m1)


# Create a new igraph object by deleting edges that are less than 2 hours long 
g2 <- delete_edges(g1, E(g1)[___ < ___])


# Plot the new graph 
w2 <- E(g2)$hours
m2 <- layout_nicely(g2)

plot(g2, 
     vertex.label.color = "black", 
     edge.color = 'black',
     edge.width = ___,
     layout = ___)
Code bewerken en uitvoeren