Toxicologiegegevens
Een toxicoloog vraagt zich af of blootstelling aan een chemische stof de sterfte verhoogt naarmate de dosis toeneemt. Ze heeft testorganismen blootgesteld aan verschillende dosissen van een chemische stof en het aantal dat stierf in elke testtank genoteerd. Elke dosis is op drie verschillende dagen herhaald.
Bouw eerst een GLM. Een eenvoudig model maken maakt debuggen makkelijker. Bovendien kun je de resultaten later vergelijken met GLMER. Dit model bevat dose en replicate als fixed effects.
Bouw daarna een GLMER. Deze keer is dose een fixed effect en is replicate een random-intercept.
Bekijk tot slot de coëfficiëntschattingen met coef() van elk model. Let op hoe de interceptschattingen in elk model verschillend worden weergegeven.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Hiërarchische en Mixed-Effects-modellen in R
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
family = "___", data = df)
coef(___)