Réaliser une ACP
L'étape suivante de votre analyse consiste à réaliser une ACP sur wisc.data.
Comme vous l'avez vu au dernier chapitre, il est important de vérifier si les données doivent être normalisées avant de faire une ACP. Rappelez-vous deux raisons courantes de normaliser les données :
- Les variables d'entrée utilisent différentes unités de mesure.
- Les variables d'entrée ont des variances considérablement différentes.
Cette activité fait partie du cours
Apprentissage non supervisé en R
Instructions de l’exercice
Les variables que vous avez créées précédemment, wisc.data et diagnosis, sont toujours disponibles dans votre espace de travail.
- Vérifiez la moyenne et l'écart type des caractéristiques pour déterminer si les données devraient être normalisées. Utilisez les fonctions
colMeans()etapply()comme vous l'avez fait auparavant. - Exécutez l'ACP sur
wisc.data, en normalisant si nécessaire, et assignez le modèle àwisc.pr. - Examinez un résumé des résultats avec la fonction
summary().
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Check column means and standard deviations
# Execute PCA, scaling if appropriate: wisc.pr
# Look at summary of results