Visualiser les arêtes

Dans cet exercice, vous apprendrez à modifier l'épaisseur des arêtes d'un réseau en fonction de leur poids, ainsi qu'à retirer des arêtes d'un réseau, ce qui peut aider à mieux visualiser des réseaux volumineux et très regroupés. Dans ce chapitre d'introduction, nous n'avons fait qu'effleurer ce qu'il est possible de faire pour visualiser des réseaux igraph. Vous continuerez à développer ces habiletés dans les prochains chapitres.

Cette activité fait partie du cours

Analyse de réseaux avec R

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Instructions de l’exercice

Créez un vecteur w1 de poids d'arêtes selon le nombre d'heures que des amis passent ensemble.
Tracez le réseau en vous assurant que edge.width est défini au vecteur de poids que vous venez de créer. Utiliser edge.color = 'black' garantit que toutes les arêtes seront noires.
Créez ensuite un nouvel objet graphe g2 qui correspond au réseau g1, mais avec toutes les arêtes dont le poids est inférieur à deux heures retirées. On procède avec delete_edges() qui prend deux arguments : le premier est l'objet graphe et le second est le sous-ensemble d'arêtes à retirer. Dans ce cas, vous retirerez toute arête dont la valeur est inférieure à deux heures.
Enfin, tracez le nouveau réseau g2 en utilisant le vecteur approprié d'épaisseurs d'arêtes et la disposition (layout) adéquate.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

library(igraph)

# Create a vector of weights based on the number of hours each pair spend together
w1 <- E(g1)$___

# Plot the network varying edges by weights
m1 <- layout_nicely(g1)
plot(g1, 
        vertex.label.color = "black", 
        edge.color = 'black',
        edge.width = ___,
        layout = m1)


# Create a new igraph object by deleting edges that are less than 2 hours long 
g2 <- delete_edges(g1, E(g1)[___ < ___])


# Plot the new graph 
w2 <- E(g2)$hours
m2 <- layout_nicely(g2)

plot(g2, 
     vertex.label.color = "black", 
     edge.color = 'black',
     edge.width = ___,
     layout = ___)

Modifier et exécuter le code