BioFabric comme composant HTML
Les diagrammes BioFabric offrent une autre façon de visualiser un graphe sans recourir à l'approche classique en « pelote de fils ». Ici, les sommets sont disposés en lignes horizontales, une par rangée, et les arêtes en lignes verticales. Lorsqu'il y a un lien entre deux sommets, une ligne verticale est tracée entre leurs rangées respectives. Par défaut, les sommets sont triés selon leur degré, ce qui crée des regroupements de forme triangulaire. Pour les graphes de grande taille, il est préférable d'enregistrer le résultat en html ou en PDF. Cette disposition évite l'emmêlement qui survient souvent lorsqu'on visualise de gros graphes. Dans cette leçon, nous allons prendre l'ensemble de données Twitter #rstats et en extraire quelques communautés. Nous le visualiserons ensuite avec ggnetwork et RBioFabric afin de comparer les deux approches.
Cette activité fait partie du cours
Études de cas : analyse de réseaux en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Make a Biofabric plot of retweet_samp
retweet_bf <- ___(___)