Provádění PCA
Dalším krokem analýzy je provést PCA na wisc.data.
V předchozí kapitole sis ukázal/a, že je důležité zkontrolovat, zda je před provedením PCA potřeba data škálovat. Připomeň si dva běžné důvody pro škálování dat:
- Vstupní proměnné používají různé jednotky měření.
- Vstupní proměnné mají výrazně odlišné rozptyly.
Toto cvičení je součástí kurzu
Unsupervised Learning in R
Pokyny k cvičení
Proměnné wisc.data a diagnosis, které jsi vytvořil/a dříve, jsou stále dostupné v tvém pracovním prostředí.
- Zkontroluj průměr a směrodatnou odchylku příznaků dat a urči, zda je nutné data škálovat. Použij funkce
colMeans()aapply()jako v předchozích cvičeních. - Proveď PCA na
wisc.data– pokud je to vhodné, data škáluj – a model ulož dowisc.pr. - Prohlédni si souhrn výsledků pomocí funkce
summary().
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Check column means and standard deviations
# Execute PCA, scaling if appropriate: wisc.pr
# Look at summary of results