Intenzita
V této kapitole budeme pracovat s rentgenovým snímkem ruky z radiologické soutěže Radiologické společnosti Severní Ameriky (RSNA, 2017). Absorpce rentgenového záření je nejvyšší v husté tkáni, jako jsou kosti, takže výsledné intenzity by měly být vysoké. Díky tomu lze takovéto snímky využít k předpovědi „kostního věku" u dětí.
Nejdřív obrázek načteme a podíváme se na rozsah jeho intenzit.
Datový typ obrázku určuje rozsah možných hodnot intenzity: například 8bitová bezznaménková celá čísla (uint8) nabývají hodnot od 0 do 255. Barevná škála (colorbar) může být užitečná pro propojení těchto hodnot s vizualizovaným obrázkem.
Všechna cvičení v této kapitole používají následující importy:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
Toto cvičení je součástí kurzu
Biomedical Image Analysis in Python
Pokyny k cvičení
- Načti obrázek „hand-xray.jpg" pomocí
imageio. - Vypiš datový typ obrázku (
dtype), jeho minimální (min()) a maximální intenzitu (max()). - Zobraz obrázek pomocí
plt.imshow(). Explicitně nastav minimální (0) a maximální (255) hodnotu barevné škály pomocí argumentůvminavmax. - Přidej barevnou škálu pomocí
plt.colorbar()a vykresli graf pomocí vlastní funkceformat_and_render_plot(). Tento krok už je hotový za tebe.
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Load the hand radiograph
im = ____
print('Data type:', ____)
print('Min. value:', ____)
print('Max value:', ____)
# Plot the grayscale image
____
plt.colorbar()
format_and_render_plot()