ПочатиПочніть безкоштовно

Обчислення кривої виживання з моделі Cox

У цій вправі ми відтворимо приклад із відео, дотримуючись таких кроків:

  • Обчислити модель Cox
  • Визначити «уявних пацієнтів»
  • Обчислити криві виживання
  • Створити data.frame з інформацією про криву виживання
  • Побудувати графік

Зараз ми зосередимося на перших трьох кроках у цій вправі, а наступні два кроки виконаємо в наступній вправі.

Пакети survival і survminer, а також дані GBSG2 уже завантажено для вас у цій вправі.

Ця вправа є частиною курсу

Аналіз виживаності в R

Переглянути курс

Інтерактивна практична вправа

Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.

# Cox model
cxmod <- ___(Surv(time, cens) ~ horTh + tsize, data = GBSG2)

# Imaginary patients
newdat <- expand.grid(
  horTh = levels(GBSG2$___),
  tsize = quantile(GBSG2$___, probs = c(0.25, 0.5, 0.75)))
___(newdat) <- letters[1:6]

# Inspect newdat
newdat
Редагувати та запускати код