Оцінювання та візуалізація кривої виживання
Розгляньмо виживаність пацієнток із раком молочної залози.
У цій вправі ми знову працюємо з набором даних GBSG2.
Пакети survival і survminer та дані GBSG2 уже завантажено для вас у цій вправі.
Ця вправа є частиною курсу
Аналіз виживаності в R
Інструкції до вправи
- Оцініть функцію виживання для пацієнток із раком молочної залози.
- Візуалізуйте оцінену функцію виживання за допомогою функції
ggsurvplot(). - Додайте до графіка таблицю ризику, що показує кількість пацієнток під спостереженням. Це можна зробити за допомогою аргументу
risk.table. - Додайте на графік лінію, що показує медіанний час виживання. Це можна зробити за допомогою аргументу
surv.median.line.
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Kaplan-Meier estimate
km <- survfit(Surv(___, ___) ~ ___, data = ___)
# Plot of the Kaplan-Meier estimate
ggsurvplot(___)
# Add the risk table to plot
ggsurvplot(___, ___ = TRUE)
# Add a line showing the median survival time
ggsurvplot(___, ___ = TRUE, ___ = "hv")