Förklarad varians
Den andra vanliga diagramtypen för att förstå PCA-modeller är ett scree plot. Ett scree plot visar den förklarade variansen när antalet principalkomponenter ökar. Ibland visas även den kumulativa förklarade variansen.
I den här och nästa övning förbereder du data från modellen pr.out som du skapade i början av kapitlet, för att kunna användas i ett scree plot. Det krävs en manuell dataförberedelse eftersom det inte finns någon inbyggd funktion i R för att skapa den här typen av diagram.
Den här övningen är en del av kursen
Oövervakad inlärning i R
Övningsinstruktioner
pr.out och datamängden pokemon finns fortfarande tillgängliga i din arbetsmiljö.
- Tilldela variabeln
pr.varkvadraten av standardavvikelserna för principalkomponenterna (dvs. variansen). Standardavvikelsen för principalkomponenterna finns i komponentensdevi PCA-modellobjektet. - Tilldela variabeln
pveandelen förklarad varians, beräknad genom att dividerapr.varmed den totala variansen som förklaras av alla principalkomponenter.
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Variability of each principal component: pr.var
pr.var <- ___
# Variance explained by each principal component: pve
pve <- ___ / ___