Opções de chunks de código R
Você viu no vídeo algumas opções de chunks de código R. Chunks de código R também podem ser nomeados. Isso faz sentido em documentos grandes, especialmente se houver um erro dentro de um chunk. Ao compilar (knit) um documento no RStudio, por exemplo, fica mais fácil localizar o erro. Alguns chunks no seu relatório foram nomeados para você entender a ideia por trás desse conceito. As opções do chunk são adicionadas após o nome do chunk e uma vírgula, assim: {r name, option = value}
Provavelmente entre as opções mais usadas estão as que controlam a exibição da saída. Por padrão, todas as saídas são mostradas em documentos RMarkdown, ou seja, mensagens, avisos e erros. Especificando opções como echo = FALSE, por exemplo, você pode ocultar o código R em si, enquanto o código ainda é executado. Consulte o vídeo para mais opções de exibição.
Lembre-se de separar o nome do chunk e as opções do chunk com uma vírgula para evitar travar sua sessão.
Este exercício faz parte do curso
Comunicando com Dados no Tidyverse
Instruções do exercício
- Na linha 14, suprima as mensagens no primeiro chunk de código R com a opção
message, de modo que a saída às vezes gerada ao carregar pacotes não seja exibida. - Na linha 64, o chunk
defining_a_themeenriquece seu relatório com um gráfico personalizado, porém o código por trás dele não é tão importante para quem lê o seu relatório.- Oculte todo o código, mas deixe o R avaliá-lo mesmo assim (se você não lembra a opção do chunk, assista novamente ao vídeo).
Exercício interativo prático
Experimente este exercício completando este código de exemplo.
{"my_document.Rmd":"---\ntitle: \"The reduction in weekly working hours in Europe\" \nsubtitle: \"Looking at the development between 1996 and 2006\"\nauthor: \"Insert your name here\"\noutput: html_document\n---\n\n## Summary \n\nThe **International Labour Organization (ILO)** has many [data sets](http://www.ilo.org/global/statistics-and-databases/lang--en/index.htm) on working conditions. For example, one can look at how weekly working hours have been decreasing in many countries of the world, while monetary compensation has risen. In this report, *the reduction in weekly working hours* in European countries is analysed, and a comparison between 1996 and 2006 is made. All analysed countries have seen a decrease in weekly working hours since 1996 – some more than others.\n\n## Preparations \n\n```{r loading_packages}\nlibrary(dplyr)\nlibrary(ggplot2)\nlibrary(forcats)\n```\n\n## Analysis\n\n### Data\n\nThe herein used data can be found in the [statistics database of the ILO](http://www.ilo.org/ilostat/faces/wcnav_defaultSelection;ILOSTATCOOKIE=ZOm2Lqrr-OIuzxNGn2_08bNe9AmHQ1kUA6FydqyZJeIudFLb2Yz5!1845546174?_afrLoop=32158017365146&_afrWindowMode=0&_afrWindowId=null#!%40%40%3F_afrWindowId%3Dnull%26_afrLoop%3D32158017365146%26_afrWindowMode%3D0%26_adf.ctrl-state%3D4cwaylvi8_4). For the purpose of this course, it has been slightly preprocessed.\n\n```{r loading_data}\nload(url(\"http://s3.amazonaws.com/assets.datacamp.com/production/course_5807/datasets/ilo_data.RData\"))\n```\n\n```{r generating_summary_statistics}\n# Some summary statistics\nilo_data %>%\n group_by(year) %>%\n summarize(mean_hourly_compensation = mean(hourly_compensation),\n mean_working_hours = mean(working_hours))\n```\n\nAs can be seen from the above table, the average weekly working hours of European countries have been descreasing since 1980.\n\n### Preprocessing\n\nThe data is now filtered so it only contains the years 1996 and 2006 – a good time range for comparison. \n\n```{r}\nilo_data <- ilo_data %>%\n filter(year == \"1996\" | year == \"2006\")\n \n# Reorder country factor levels\nilo_data <- ilo_data %>%\n # Arrange data frame first, so last is always 2006\n arrange(year) %>%\n # Use the fct_reorder function inside mutate to reorder countries by working hours in 2006\n mutate(country = fct_reorder(country,\n working_hours,\n last))\n``` \n\n### Results\n\nIn the following, a plot that shows the reduction of weekly working hours from 1996 to 2006 in each country is produced.\n\nFirst, a custom theme is defined.\n\n```{r defining_a_theme}\n# Better to define your own function than to always type the same stuff\ntheme_ilo <- function(){\n theme_minimal() +\n theme(\n text = element_text(family = \"Bookman\", color = \"gray25\"),\n plot.subtitle = element_text(size = 12),\n plot.caption = element_text(color = \"gray30\"),\n plot.background = element_rect(fill = \"gray95\"),\n plot.margin = unit(c(5, 10, 5, 10), units = \"mm\")\n )\n}\n``` \n\nThen, the plot is produced. \n\n```{r}\n# Compute temporary data set for optimal label placement\nmedian_working_hours <- ilo_data %>%\n group_by(country) %>%\n summarize(median_working_hours_per_country = median(working_hours)) %>%\n ungroup()\n\n# Have a look at the structure of this data set\nstr(median_working_hours)\n\n# Plot\nggplot(ilo_data) +\n geom_path(aes(x = working_hours, y = country),\n arrow = arrow(length = unit(1.5, \"mm\"), type = \"closed\")) +\n # Add labels for values (both 1996 and 2006)\n geom_text(\n aes(x = working_hours,\n y = country,\n label = round(working_hours, 1),\n hjust = ifelse(year == \"2006\", 1.4, -0.4)\n ),\n # Change the appearance of the text\n size = 3,\n family = \"Bookman\",\n color = \"gray25\"\n ) +\n # Add labels for country\n geom_text(data = median_working_hours,\n aes(y = country,\n x = median_working_hours_per_country,\n label = country),\n vjust = 2,\n family = \"Bookman\",\n color = \"gray25\") +\n # Add titles\n labs(\n title = \"People work less in 2006 compared to 1996\",\n subtitle = \"Working hours in European countries, development since 1996\",\n caption = \"Data source: ILO, 2017\"\n ) +\n # Apply your theme \n theme_ilo() +\n # Remove axes and grids\n theme(\n axis.ticks = element_blank(),\n axis.title = element_blank(),\n axis.text = element_blank(),\n panel.grid = element_blank(),\n # Also, let's reduce the font size of the subtitle\n plot.subtitle = element_text(size = 9)\n ) +\n # Reset coordinate system\n coord_cartesian(xlim = c(25, 41))\n```\n\n\n"}