Varians yang dijelaskan
Jenis plot umum kedua untuk memahami model PCA adalah scree plot. Scree plot menampilkan varians yang dijelaskan seiring bertambahnya jumlah principal component. Terkadang kumulatif varians yang dijelaskan juga diplotkan.
Dalam latihan ini dan berikutnya, Anda akan menyiapkan data dari model pr.out yang Anda buat di awal bab untuk digunakan dalam scree plot. Menyiapkan data untuk pemetaan diperlukan karena tidak ada fungsi bawaan di R untuk membuat jenis plot ini.
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Unsupervised Learning di R
Petunjuk latihan
pr.out dan data pokemon masih tersedia di ruang kerja Anda.
- Isikan ke variabel
pr.varkuadrat dari simpangan baku principal component (yaitu varians). Simpangan baku principal component tersedia pada komponensdevdari objek model PCA. - Isikan ke variabel
pveproporsi varians yang dijelaskan, dihitung dengan membagipr.vardengan total varians yang dijelaskan oleh semua principal component.
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Variability of each principal component: pr.var
pr.var <- ___
# Variance explained by each principal component: pve
pve <- ___ / ___