Varians yang dijelaskan

Jenis plot umum kedua untuk memahami model PCA adalah scree plot. Scree plot menampilkan varians yang dijelaskan seiring bertambahnya jumlah principal component. Terkadang kumulatif varians yang dijelaskan juga diplotkan.

Dalam latihan ini dan berikutnya, Anda akan menyiapkan data dari model pr.out yang Anda buat di awal bab untuk digunakan dalam scree plot. Menyiapkan data untuk pemetaan diperlukan karena tidak ada fungsi bawaan di R untuk membuat jenis plot ini.

Latihan ini merupakan bagian dari kursus

Unsupervised Learning di R

Instruksi latihan

pr.out dan data pokemon masih tersedia di ruang kerja Anda.

Isikan ke variabel pr.var kuadrat dari simpangan baku principal component (yaitu varians). Simpangan baku principal component tersedia pada komponen sdev dari objek model PCA.
Isikan ke variabel pve proporsi varians yang dijelaskan, dihitung dengan membagi pr.var dengan total varians yang dijelaskan oleh semua principal component.

Latihan interaktif langsung praktik

Cobalah latihan ini dengan melengkapi kode contoh ini.

# Variability of each principal component: pr.var
pr.var <- ___

# Variance explained by each principal component: pve
pve <- ___ / ___

Edit dan Jalankan Kode

Latihan ini merupakan bagian dari kursus

Unsupervised Learning di R

SkillTag.level.intermediateSkillTag.label

4.8+

Mulai Kursus Gratis

Algoritma k-means adalah salah satu pendekatan umum untuk clustering. Pelajari bagaimana algoritma ini bekerja di balik layar, terapkan clustering k-means di R, visualisasikan dan interpretasikan hasilnya, serta pilih jumlah klaster saat jumlahnya tidak diketahui sebelumnya. Pada akhir bab, Anda akan menerapkan clustering k-means pada himpunan data "dunia nyata" yang menyenangkan!

Exercise 1: Selamat datang di kursus ini!Exercise 2: Identifikasi masalah clustering Exercise 3: Pengenalan pengelompokan k-means Exercise 4: Pengelompokan k-means Exercise 5: Hasil dari kmeans()Exercise 6: Memvisualisasikan dan menafsirkan hasil kmeans()Exercise 7: Cara kerja k-means dan hal-hal praktis Exercise 8: Menangani algoritme acak Exercise 9: Memilih jumlah klaster Exercise 10: Pengantar data Pokemon Exercise 11: Hal-hal praktis: bekerja dengan data nyata Exercise 12: Tinjauan k-means clustering

Hierarchical clustering adalah metode populer lainnya untuk clustering. Tujuan bab ini adalah membahas cara kerjanya, cara menggunakannya, dan bagaimana perbandingannya dengan clustering k-means.

Exercise 1: Pengantar pengelompokan hierarkis Exercise 2: Pengelompokan hierarkis dengan hasil Exercise 3: Memilih jumlah klaster Exercise 4: Menafsirkan dendrogram Exercise 5: Memotong pohon Exercise 6: Keterkaitan clustering dan hal-hal praktis Exercise 7: Metode linkage Exercise 8: Membandingkan metode linkage Exercise 9: Hal praktis: penskalaan Exercise 10: Membandingkan kmeans() dan hclust()Exercise 11: Tinjauan pengelompokan hierarkis

Principal component analysis, atau PCA, adalah pendekatan umum untuk pengurangan dimensi. Pelajari secara tepat apa yang dilakukan PCA, visualisasikan hasil PCA dengan biplot dan scree plot, serta tangani isu-isu praktis seperti melakukan centering dan scaling pada data sebelum menjalankan PCA.

Exercise 1: Pengantar PCA Exercise 2: PCA menggunakan prcomp()Exercise 3: Hasil PCA Exercise 4: Hasil tambahan dari PCA Exercise 5: Memvisualisasikan dan menafsirkan hasil PCA Exercise 6: Menafsirkan biplot (1)Exercise 7: Menafsirkan biplot (2)Exercise 8: Varians yang dijelaskan

Latihan Saat Ini

Exercise 9: Visualisasikan ragam yang dijelaskan Exercise 10: Isu praktis pada PCA Exercise 11: Isu praktis: penskalaan Exercise 12: Kegunaan tambahan PCA dan rangkuman

Tujuan bab ini adalah membimbing Anda melalui analisis lengkap menggunakan teknik unsupervised learning yang dibahas dalam tiga bab pertama. Anda akan memperluas apa yang telah dipelajari dengan menggabungkan PCA sebagai langkah prapemrosesan untuk clustering menggunakan data yang terdiri atas pengukuran inti sel dari massa payudara manusia.

Exercise 1: Pengantar studi kasus Exercise 2: Menyiapkan data Exercise 3: Analisis data eksploratori Exercise 4: Melakukan PCA Exercise 5: Menafsirkan hasil PCA Exercise 6: Varians yang dijelaskan Exercise 7: Ulasan PCA dan langkah selanjutnya Exercise 8: Mengkomunikasikan hasil PCA Exercise 9: Klasterisasi hierarkis pada data studi kasus Exercise 10: Hasil pengelompokan hierarkis Exercise 11: Memilih jumlah klaster Exercise 12: Klasterisasi k-means dan membandingkan hasil Exercise 13: Clustering pada hasil PCA Exercise 14: Ringkasan dan tinjauan