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Visualiser la variance expliquée

Avec tous ces calculs en main, il est toujours utile de représenter nos données visuellement. Vous allez maintenant créer un diagramme en colonnes montrant la variance expliquée par composante principale.

Le vecteur variable_explained que vous avez créé dans le dernier exercice est disponible, et le theme_() de ggplot() est réglé à « classic ».

Cette activité fait partie du cours

Ingénierie des caractéristiques en R

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Instructions de l’exercice

  • Utilisez l'information dans le tibble de l'ACP pour créer un diagramme en colonnes de la variance expliquée.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

PCA = tibble(PC = 1:length(sdev), var_explained = var_explained, 
       cumulative = cumsum(var_explained))

# Use the information in the PCA tibble to create a column plot of variance explained
PCA %>% ggplot(aes(x = ___, y = ___)) +
  geom_col(fill = "steelblue") +
  xlab("Principal components") +
  ylab("Variance explained")
Modifier et exécuter le code